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Biopolímeros (4831) |
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Módulo 7. Ficha
7.2
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INTERACCIÓN BIOPOLÍMEROS-LIGANDOS
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Configuraciones posibles para una molécula con dos sitios de unión y constantes de unión microscópicas.La figura anterior es una representación esquemática del modelo de una macromolécula con dos sitios de unión idénticos. Existen dos formas microscópicas de la molécula con un sitio ocupado y sólo una de la molécula con los dos sitios ocupados o con los dos sitios vacíos. Que los dos sitios de unión sean idénticos, no significa que tengan las mismas constantes de unión, sino que son indistinguibles y por tanto no hay ningún orden preestablecido sobre cual se llenará primero. Se tienen por tanto dos constantes de unión microscópicas definidas como:
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Variación relativa de las energías de Gibbs del sistema cuando se adicionan la primera y la segunda molécula de ligando: Cooperatividad
1k2 > 2k2; la unión del substrato al primer sitio disminuye su afinidad por el segundo sitio - Cooperatividad homotrópica negativa . Caso A 1k2 = 2k2; el que el primer sitio esté ocupado no altera la constante de unión del segundo - No cooperatividad. Caso B 1k2 < 2k2; la unión del substrato al primer sitio aumenta su afinidad por el segundo sitio - Cooperatividad homotrópica positiva. Caso C
Variación de las fracciones molares de las especies con el logaritmo neperiano de la concentración de ligando.Teniendo en cuenta el valor de las fracciones molares:
- Si X = 1/ 1k2 (ln X = - ln1k2 ); 0F2 = (1/2) 1F2
- Si X = 2k2 (ln X = - ln2k2 ) 2F2 = (1/2) 1F2
Los patrones son distintos dependiendo de si el sistema presente cooperatividad negativa (A), no presenta cooperatividad (B) o cooperatividad positiva.(C)Teniendo en cuenta que 0M2 = 0M'2 ; 1M2 =2 1M'2 ; 2M2 = 2M'2 puede comprobarse que el polinomio de unión en este caso es: 2Px = 1 + 2 1k2 x + 1k2 2k2 x2; y la fracción molar de cada una de las formas es:
0F2 = 1/2Px ; 1F2 = 2 1k2 x / 2Px ; 2F2 = 1k2 2k2 x2 / 2Px
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